El análisis físico-químico y bactereológico del agua permite conocer su calidad química para determinar su uso. 

Los análisis del agua o hidrogeoquímica como método de exploración permite determinar zonas mineras, conocer e identificar tipos de agua, edad del agua, plumas de contaminantes, calidades, origen, por cual tipo de roca ha fluido, cantidad de sólidos totales disueltos, etc.

Es de gran importancia llevarlos a cabo ya que muchas de las enfermedades que sufre el ser humano es debido al agua que ingiere. 

Clínicamente en algunos estados el agua ha provocado, cáncer, cálculos en los riñones y vesícula, diarreas, etc.

En estudios de zonas mineras o zonas industriales, es indispensable conocer cual es nivel de la calidad de agua antes de efectuar cualquier construcción y una vez construidas es necesario realizar nuevos estudios, con la finalidad de no afectar la calidad inicial y con ello evitar futuras demandas ambientales por los desechos que se vierten.